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蛋白提取相關(guān)知識介紹
點擊次數(shù):521 更新時間:2025-05-30

蛋白提取相關(guān)知識介紹

蛋白作為生命活動的基本功能單位, 是經(jīng)典的生物標(biāo)志物, 常用于蛋白質(zhì)免疫印跡(Western Blot,WB)、蛋白質(zhì)免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)、免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)、染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)、聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamidegel electrophoresis,PAGE)實驗等。為了實現(xiàn)我們的研究目的, 需要將蛋白從細(xì)胞組織中提取分離出來, 這一過程即為蛋白提取,提取出高質(zhì)量的蛋白是后續(xù)實驗成功的先決條件。

在分離之前, 需要用一定的方式進(jìn)行細(xì)胞裂解, 細(xì)胞裂解方法包括化學(xué)裂解、酶裂解和機械裂解。化學(xué)裂解和酶裂解(包括SDS和溶菌酶處理等) 通常是比較溫和的方法, 通常會很少使DNA斷裂,是提取純化蛋白時常用的方法。機械裂解可以更均一的裂解細(xì)胞, 同化學(xué)裂解相比, 機械處理更劇烈和更全面, 具有更高的裂解效率和更低的選擇性,但也會造成DNA的斷裂。

常用的蛋白類型

根據(jù)細(xì)胞內(nèi)定位的不同一般可以分為總蛋白、膜蛋白、胞漿蛋白、核蛋白。在提取過程中要注意以下事項:

1. 膜蛋白

通過勻漿適度破碎細(xì)胞, 經(jīng)低速離心去除細(xì)胞核和少數(shù)未破碎的細(xì)胞產(chǎn)生的沉淀, 隨后取上清高速離心獲得細(xì)胞膜沉淀和含有細(xì)胞漿蛋白的上清, 然后通過優(yōu)化的膜蛋白抽提試劑從沉淀中抽提獲取膜蛋白。抽提的膜蛋白不僅包括質(zhì)膜上的膜蛋白,也包括線粒體膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜和高爾基體膜等上的膜蛋白。

2. 胞漿蛋白

在低滲透壓條件下, 使細(xì)胞充分膨脹, 然后破壞細(xì)胞膜, 釋放出細(xì)胞漿蛋白,選用合適的抽提試劑進(jìn)行提取操作。

3. 核蛋白

在低滲透壓條件下, 使細(xì)胞充分膨脹破壞細(xì)胞膜后, 通過離心得到細(xì)胞核沉淀,通過高鹽的細(xì)胞核蛋白抽提試劑抽提得到細(xì)胞核蛋白。

不同樣本類型的提取方法(以總蛋白為例)

1. 培養(yǎng)的細(xì)胞

(1) 貼壁細(xì)胞

① 倒掉培養(yǎng)液,將瓶倒扣在吸水紙上使吸水紙吸干培養(yǎng)液(或?qū)⑵恐绷⒎胖靡粫菏箽堄嗯囵B(yǎng)液流到瓶底然后再用移液器將其吸走);

② 每瓶細(xì)胞(一般需要5*10 6細(xì)胞) 加預(yù)冷的PBS0.01M pH7.27.3)清洗后棄去洗液。重復(fù)以上操作兩次, 共洗細(xì)胞三次以洗去培養(yǎng)液。將PBS棄凈后把培養(yǎng)瓶置于冰上;

③ 每瓶細(xì)胞加含PMSF的裂解液, 于冰上充分裂解,為使細(xì)胞充分裂解培養(yǎng)瓶要經(jīng)常來回?fù)u動;

④ 裂解完后, 用干凈的刮棒將細(xì)胞刮于培養(yǎng)瓶的一側(cè)(動作要快), 然后用槍將細(xì)胞碎片和裂解液移至新的離心管中(整個操作盡量在冰上進(jìn)行);

⑤ 于4℃下12000rpm離心20min。(提前開離心機預(yù)冷);

⑥ 將離心后的上清分裝,于-80℃保存。

(2) 懸浮細(xì)胞

離心收集細(xì)胞,用手指把細(xì)胞用力彈散。按照6孔板每孔細(xì)胞加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。再用手指輕彈以充分裂解細(xì)胞。充分裂解后應(yīng)沒有明顯的細(xì)胞沉淀。如果細(xì)胞量較多,必需分裝成50-100萬細(xì)胞/管,然后再裂解。

(3) 加藥的貼壁細(xì)胞

由于受藥物的影響, 一些細(xì)胞脫落下來,所以除按貼壁細(xì)胞操作外還應(yīng)收集培養(yǎng)液中的細(xì)胞。以下是培養(yǎng)液中細(xì)胞總蛋白的提取:

① 將培養(yǎng)液倒至15ml離心管中,于2500rpm離心5min

② 棄上清,加入PBS并用槍輕輕吹打洗滌,然后2500rpm離心5min。棄上清后用PBS重復(fù)洗滌一次;

③ 用槍吸干上清后, 加100μL裂解液(含PMSF)冰上裂解, 裂解過程中要經(jīng)常彈一彈以使細(xì)胞充分裂解;

④ 將裂解液與培養(yǎng)瓶中裂解液混在一起4℃、12000rpm離心20min,取上清分裝并置于-80℃保存。

2. 組織細(xì)胞

組織樣品的蛋白抽提時,必須進(jìn)行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,離心要充分,組織中的蛋白酶活性更強,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋白酶抑制劑cocktail),操作如下:

(1) 將少量剪碎的組織塊置于玻璃勻漿器中, 加入裂解液裂(含PMSF)進(jìn)行冰上勻漿。

(2) 充分裂解后,即可用移液器將裂解液移至1.5ml離心管中,然后在4℃下12000rpm離心20min,取上清分裝并置于-80℃保存。

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